インドネシアの法律上は送金額の上限は規定されておりません。
一方で、銀行ごとに独自の規定がある場合がありますので、ご利用の銀行へ直接ご確認いただくとよろしいかと思います。
また、現地法人の場合は配当の支払いなどでPPh26(国外サービスにかかる源泉税)が課税されますが、駐在員事務所から日本本社への送金には税金は発生しません。